甘肃省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所隶属于甘肃省农业科学院，创建于2011年。前身为甘肃省农业科学院农业测试中心，成立于1959年，原名为“甘肃省农业科学院综合化验室”；1984年2月更名为“甘肃省农业科学院中心测试室”，1999年再次改名为“甘肃省农业科学院农业测试中心”。2002年12月通过了甘肃省质量技术监督局首次计量认证。2006年5月由中国绿色食品协会批准成立了“绿色农业兰州研究中心”；2006年11月在原甘肃省农业科学院农业测试中心基础上成立了“甘肃省农业科学院畜草品种改良研究所”， 2009年2月更名为“甘肃省农业科学院畜草与绿色农业研究所”；2011年11月在“甘肃省农业科学院畜草与绿色农业研究所”加挂“甘肃省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所”，同年12月被农业部授予“农业部农产品质量安全风险评估实验室（兰州）”。2013年4月，甘肃省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所与甘肃省农业科学院畜草与绿色农业研究所院内分开独立运行。